ความแตกต่างระหว่าง GFP และ YFP (พร้อมตาราง)

สารบัญ:

Anonim

ส่วนที่ลึกที่สุดของทะเลหรือมหาสมุทรไม่ได้รับแสงแดดแม้ในเวลากลางวัน สิ่งมีชีวิตที่อาศัยอยู่ในส่วนที่ลึกที่สุดของทะเลหรือมหาสมุทรมีความได้เปรียบของแสงในร่างกายโดยธรรมชาติ ลักษณะเฉพาะในสัตว์นี้เรียกว่าการเรืองแสงทางชีวภาพ สิ่งนี้ช่วยให้พวกมันล่าเหยื่อและบางครั้งก็ซ่อนตัวจากผู้ล่า บางคนก็ใช้สิ่งนี้ในขณะที่เราใช้คบเพลิง สารเคมีที่ช่วยในการสร้างแสงเรืองนี้จะแตกต่างกันไปในทุกสิ่งมีชีวิต Aequorea Victoria เป็นแมงกะพรุนที่สร้าง GFP เพื่อการเรืองแสง หากต้องการทราบข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับโปรตีนนี้ ต่อไปนี้คือข้อแตกต่างบางประการระหว่าง GFP และ YFP

GFP กับ YFP

ความแตกต่างระหว่าง GFP และ YFP คือ GFP เป็นโปรตีนหลักที่ผลิตในแมงกะพรุน และ YFP เป็นเวอร์ชันที่กลายพันธุ์ของ YFP GFP คือโปรตีนเรืองแสงสีเขียว และ YFP คือโปรตีนเรืองแสงสีเหลือง พวกมันยังมีสีต่างกัน ตัวหนึ่งเป็นสีเขียว และอีกตัวเป็นสีเหลือง โปรตีนเรืองแสงสีเหลืองมีพีคของการปล่อยและกระตุ้นที่สูงกว่าเมื่อเปรียบเทียบกับพีคของการปลดปล่อยและการกระตุ้นของโปรตีนเรืองแสงสีเขียว

GFP แบบเต็มคือโปรตีนเรืองแสงสีเขียว มันถูกพบในแมงกะพรุนที่เรียกว่า Aequorea Victoria ลักษณะสำคัญของ GFP คือจะปล่อยเรืองแสงสีเขียวเมื่อสัมผัสกับรังสีอัลตราไวโอเลตที่เบลอ โปรตีนนี้ประกอบด้วยกรดอะมิโน 238 ตัว นอกจากนี้ยังมีเวอร์ชันที่ปรับปรุงแล้วซึ่งส่วนใหญ่ใช้สำหรับการทดลอง สิ่งเหล่านี้ใช้ในการผลิตยีนใหม่ในเซลล์และสาขาอณูชีววิทยา

รูปแบบที่สมบูรณ์ของ YFP คือโปรตีนเรืองแสงสีเหลือง เป็นเวอร์ชันปิดเสียงของ Green Fluorescent Protein ที่พบใน Aequorea Victoria โปรตีนนี้ปล่อยแสงเรืองแสงสีเหลืองเมื่อสัมผัสกับรังสียูวีสีน้ำเงิน มีสามเวอร์ชันที่ปรับปรุงแล้ว ได้แก่ Ypet, Citrine และ Venus โปรตีนนี้ยังใช้สำหรับการทดลองในเซลล์และอณูชีววิทยา

ตารางเปรียบเทียบระหว่าง GFP และ YFP

พารามิเตอร์ของการเปรียบเทียบ

GFP

YFP

ตัวเต็ม โปรตีนเรืองแสงสีเขียว โปรตีนเรืองแสงสีเหลือง
ที่ได้มาจาก Aequorea Victoria ซึ่งเป็นแมงกะพรุนชนิดหนึ่ง การกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมของโปรตีนเรืองแสงสีเขียว
ค่าสูงสุดของการกระตุ้น (ความยาวคลื่น) 395 นาโนเมตร 515 นาโนเมตร
ค่าสูงสุดของการปล่อย (ความยาวคลื่น) 509 นาโนเมตร 527 นาโนเมตร
รุ่นปรับปรุง smRS-GFP Ypet, ซิทริน, วีนัส

GFP คืออะไร?

GFP แบบเต็มคือโปรตีนเรืองแสงสีเขียว มันถูกพบในแมงกะพรุนที่เรียกว่า Aequorea Victoria ลักษณะสำคัญของ GFP คือจะปล่อยเรืองแสงสีเขียวเมื่อสัมผัสกับรังสีอัลตราไวโอเลตที่เบลอ โปรตีนนี้ประกอบด้วยกรดอะมิโน 238 ตัว มวลโมเลกุลของมันคือ 27kD นอกจากนี้ยังมีเวอร์ชันที่ปรับปรุงแล้วซึ่งส่วนใหญ่ใช้สำหรับการทดลอง

โปรตีนนี้มีความยาวคลื่นเรืองแสงของประเภทการปล่อยและประเภทการกระตุ้น พีคการแผ่รังสีคือช่วงที่รังสีถูกปล่อยออกมา และพีคของการกระตุ้นคือเมื่อโฟตอนตื่นเต้นและเริ่มเปล่งแสง ค่าสูงสุดของการกระตุ้นคือ 395 นาโนเมตร และค่าสูงสุดของการปล่อยคือ 515 นาโนเมตร

GFP มีการประยุกต์ใช้ที่สำคัญในการวิจัยเซลล์และโมเลกุล โปรตีนนี้ถูกใช้เป็นยีนนักข่าวโดยนักวิทยาศาสตร์ในเซลล์และโมเลกุล ยีนนักข่าวเป็นยีนชนิดหนึ่งที่ติดอยู่กับยีนอื่นที่ใช้สำหรับการทดลองตามลำดับและระบุได้ง่ายเมื่อเทียบกับยีนหลัก สิ่งนี้ถูกใช้เป็นยีนนักข่าวเนื่องจากมีลักษณะการเรืองแสงทางชีวภาพ

โปรตีนนี้มีข้อดีอื่น ๆ อีกมากมายเช่นกัน ยีนนี้เป็นกรรมพันธุ์ และยังไม่ทำปฏิกิริยากับยีนอื่นในทางชีววิทยา ดังนั้นสำหรับการวิจัย ยีนนี้เป็นที่ต้องการเป็นส่วนใหญ่

YFP คืออะไร?

รูปแบบที่สมบูรณ์ของ YFP คือโปรตีนเรืองแสงสีเหลือง เป็นเวอร์ชันปิดเสียงของ Green Fluorescent Protein ที่พบใน Aequorea Victoria โปรตีนนี้ปล่อยแสงเรืองแสงสีเหลืองเมื่อสัมผัสกับรังสียูวีสีน้ำเงิน มีสามเวอร์ชันที่ปรับปรุงแล้ว ได้แก่ Ypet, Citrine และ Venus โปรตีนนี้ยังใช้สำหรับการทดลองทางจุลชีววิทยา

โปรตีนเรืองแสงสีเหลืองเกิดขึ้นหลังจากการกลายพันธุ์สี่ครั้งของโปรตีนเรืองแสงสีเขียวที่หลากหลายที่พบในแมงกะพรุนใต้ทะเลลึกที่เรียกว่าอีโคเรียวิกตอเรีย การเปลี่ยนแปลงหลักและสำคัญที่สุดของการกลายพันธุ์คือการแทนที่ threonine ด้วยสารเคมีอีกชนิดหนึ่งที่เรียกว่า tyrosine ที่ตำแหน่ง 203 การเปลี่ยนแปลงนี้ทำให้เกิดตัวแปร YFP ค่าสูงสุดของการกระตุ้นของ YFP คือ 515 นาโนเมตร และค่าสูงสุดของการปล่อยคือ 527 นาโนเมตร พีคทั้งสองจะสูงกว่าเมื่อเทียบกับ GFP ระดับบนสุด

YFP เวอร์ชันที่ปรับปรุงแล้ว ได้แก่ Ypet, Citrine และ Venus มีข้อดีมากกว่าโปรตีนหลัก สิ่งเหล่านี้คือว่าแวเรียนต์ที่ปรับปรุงแล้วเหล่านี้มีการสุกเร็วขึ้น การเรืองแสงเพิ่มขึ้น และความไวต่อคลอไรด์ที่ลดลงเมื่อเทียบกับ YFP แม่ YFP ยังใช้ในด้านเซลล์และอณูชีววิทยา ส่วนใหญ่จะใช้ YFP เป็นตัวรับสำหรับยีนเซ็นเซอร์ที่เข้ารหัสทางพันธุกรรม ตัวแปร Venus มีการเปลี่ยนแปลงในลำดับกรดอะมิโนใหม่

ความแตกต่างหลักระหว่าง GFP และ YFP

บทสรุป

โปรตีนเหล่านี้ส่วนใหญ่พบในสัตว์น้ำที่อาศัยอยู่ลึกใต้มหาสมุทร สิ่งเหล่านี้มีความสำคัญต่อการอยู่รอดของพวกเขา GFP และ YFP เป็นเพียงตัวอย่างสารเคมีที่พบในแมงกะพรุนที่เรียกว่า Aequorea Victoria มีสารเคมีประเภทนี้จำนวนไม่ จำกัด ที่พบในสิ่งมีชีวิตต่าง ๆ ตามความต้องการเพื่อความอยู่รอด

ทุกวันนี้ ยีนในโปรตีนของพวกมันถูกใช้เพื่อการวิจัยและนำไปสู่การกำเนิดของยีนใหม่มากมายจากการเรียงสับเปลี่ยนร่วมกับยีนอื่นๆ สิ่งเหล่านี้บางส่วนมีข้อดีที่แตกต่างกันซึ่งนำไปสู่การใช้งานในพื้นที่ที่ต้องการ

อ้างอิง

ความแตกต่างระหว่าง GFP และ YFP (พร้อมตาราง)